Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Top2bQ64511 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms