Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ca4Q64444 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms