Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Irf4Q64287 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms