Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
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