Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms