Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms