Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms