Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms