Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp1Q62442 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms