Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Hoxa13Q62424 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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Hoxa13Q62424 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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Hoxa13Q62424 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa13Q62424 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.5 ms