Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sh3gl2Q62420 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Sh3gl2Q62420 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Sh3gl2Q62420 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3gl2Q62420 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3gl2Q62420 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3gl2Q62420 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3gl2Q62420 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Sh3gl2Q62420 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3gl2Q62420 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3gl2Q62420 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3gl2Q62420 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3gl2Q62420 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sh3gl2Q62420 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sh3gl2Q62420 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sh3gl2Q62420 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sh3gl2Q62420 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Sh3gl2Q62420 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms