Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Supt6hQ62383 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Supt6hQ62383 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms