Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SypQ62277 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SypQ62277 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SypQ62277 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SypQ62277 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SypQ62277 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SypQ62277 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SypQ62277 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SypQ62277 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SypQ62277 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SypQ62277 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SypQ62277 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SypQ62277 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SypQ62277 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SypQ62277 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SypQ62277 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SypQ62277 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SypQ62277 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SypQ62277 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SypQ62277 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SypQ62277 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SypQ62277 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SypQ62277 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SypQ62277 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SypQ62277 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SypQ62277 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SypQ62277 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SypQ62277 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SypQ62277 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SypQ62277 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SypQ62277 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SypQ62277 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SypQ62277 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SypQ62277 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms