Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms