Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhocQ62159 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhocQ62159 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms