Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms