Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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Prm3Q62100 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Gm26706-201ENSMUST00000180718 746 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Prm3Q62100 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Prm3Q62100 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Prm3Q62100 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Prm3Q62100 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Prm3Q62100 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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Prm3Q62100 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Prm3Q62100 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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Prm3Q62100 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Prm3Q62100 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Prm3Q62100 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Prm3Q62100 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Prm3Q62100 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Vmn1r-ps110-201ENSMUST00000117530 1094 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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Prm3Q62100 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Sh2d1a-207ENSMUST00000189753 1223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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Prm3Q62100 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms