Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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AtrxQ61687 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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AtrxQ61687 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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AtrxQ61687 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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AtrxQ61687 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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AtrxQ61687 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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AtrxQ61687 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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AtrxQ61687 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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AtrxQ61687 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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AtrxQ61687 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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AtrxQ61687 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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