Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itm2aQ61500 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itm2aQ61500 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itm2aQ61500 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itm2aQ61500 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itm2aQ61500 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itm2aQ61500 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itm2aQ61500 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itm2aQ61500 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itm2aQ61500 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itm2aQ61500 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itm2aQ61500 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itm2aQ61500 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms