Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms