Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Irf9Q61179 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf9Q61179 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms