Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Scarb1Q61009 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb1Q61009 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb1Q61009 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Scarb1Q61009 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb1Q61009 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb1Q61009 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb1Q61009 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb1Q61009 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb1Q61009 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb1Q61009 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb1Q61009 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb1Q61009 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb1Q61009 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb1Q61009 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb1Q61009 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb1Q61009 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scarb1Q61009 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scarb1Q61009 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scarb1Q61009 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scarb1Q61009 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scarb1Q61009 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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