Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms