Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms