Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Neurod1Q60867 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurod1Q60867 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurod1Q60867 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurod1Q60867 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurod1Q60867 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurod1Q60867 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurod1Q60867 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurod1Q60867 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurod1Q60867 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurod1Q60867 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurod1Q60867 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurod1Q60867 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms