Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms