Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms