Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms