Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm1Q60636 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm1Q60636 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms