Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CttnQ60598 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CttnQ60598 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CttnQ60598 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CttnQ60598 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CttnQ60598 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms