Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms