Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ssh2Q5SW75 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssh2Q5SW75 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms