Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms