Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms