Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Sco1Q5SUC9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Sco1Q5SUC9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Sco1Q5SUC9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Sco1Q5SUC9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Sco1Q5SUC9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Sco1Q5SUC9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms