Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms