Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms