Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm12253Q5NC48 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm12253Q5NC48 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm12253Q5NC48 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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