Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms