Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms