Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZJ0

Drosha, Ribonuclease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DroshaQ5HZJ0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DroshaQ5HZJ0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DroshaQ5HZJ0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms