Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf3Q5HZG4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms