Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Nlrc3Q5DU56 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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