Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT8

Pnma5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma5Q5DTT8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pnma5Q5DTT8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pnma5Q5DTT8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pnma5Q5DTT8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pnma5Q5DTT8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pnma5Q5DTT8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pnma5Q5DTT8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pnma5Q5DTT8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pnma5Q5DTT8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pnma5Q5DTT8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pnma5Q5DTT8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pnma5Q5DTT8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pnma5Q5DTT8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pnma5Q5DTT8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pnma5Q5DTT8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma5Q5DTT8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms