Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E7

Zc3h12a, Endoribonuclease ZC3H12A, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12aQ5D1E7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3h12aQ5D1E7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms