Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ndufaf2Q59J78 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufaf2Q59J78 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufaf2Q59J78 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufaf2Q59J78 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufaf2Q59J78 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufaf2Q59J78 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufaf2Q59J78 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufaf2Q59J78 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufaf2Q59J78 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufaf2Q59J78 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufaf2Q59J78 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufaf2Q59J78 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufaf2Q59J78 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufaf2Q59J78 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufaf2Q59J78 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufaf2Q59J78 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufaf2Q59J78 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufaf2Q59J78 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufaf2Q59J78 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufaf2Q59J78 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufaf2Q59J78 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufaf2Q59J78 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufaf2Q59J78 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufaf2Q59J78 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms