Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf354cQ571J5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354cQ571J5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms