Protein–RNA interactions for Protein: Q56A07

Scn2b, Sodium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2bQ56A07 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn2bQ56A07 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms