Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eme2Q56A04 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms