Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms